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ログビー、宮崎大学医学部附属病院、千葉大学医学部附属病院、産業技術大学院大学での共同研究による、匿名加工データ分析基盤の構築 データ基盤構築

課題

ログビー、宮崎大学医学部附属病院、千葉大学医学部附属病院、産業技術大学院大学での共同研究による、入院後合併症の予測モデルの開発では、大規模な匿名加工データを扱うにあたり、以下の課題がありました。

  • テラバイト級の匿名加工データをセキュアに保管するストレージとデータベースが必要
  • オンプレミスのGPUサーバーを使った予測モデルの学習・推論が必要
  • 上記のストレージとデータベース、GPUサーバーをセキュアにシームレスにつなぎ効率的に分析を行う環境が必要

ソリューション

上記課題に対し、AWSとオンプレミス環境をシームレスに繋ぐデータ基盤を構築しました。

  • AWSのVPCを用いてセキュアなネットワーク環境を構築し、匿名加工データを配置
  • AWSの認証基盤により、オンプレミスのGPUサーバーからセキュアにAWS環境に接続
  • 上記インフラ環境にて、データ前処理パイプライン(ETL:Extract/Transform/Load)の構築と予測モデルの学習・推論を実施

効果

第39回医療情報学連合大会(第20回日本医療情報学会学術大会)にて研究成果を発表し、医療情報学の発展に寄与しました。

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